Protein–RNA interactions for Protein: P46718

Pdcd2, Programmed cell death protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd2P46718 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pdcd2P46718 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pdcd2P46718 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pdcd2P46718 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pdcd2P46718 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms