Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Klf1P46099 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Klf1P46099 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klf1P46099 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Klf1P46099 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klf1P46099 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Klf1P46099 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Klf1P46099 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Klf1P46099 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.6 ms