Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Upk2P38575 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk2P38575 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk2P38575 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Upk2P38575 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk2P38575 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk2P38575 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upk2P38575 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms