Protein–RNA interactions for Protein: P35846

Folr1, Folate receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Folr1P35846 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Folr1P35846 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Folr1P35846 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Folr1P35846 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Folr1P35846 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Folr1P35846 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Folr1P35846 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Folr1P35846 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Folr1P35846 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Folr1P35846 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Folr1P35846 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Folr1P35846 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Folr1P35846 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Folr1P35846 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Folr1P35846 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Folr1P35846 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Folr1P35846 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms