Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ly6dP35459 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ly6dP35459 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ly6dP35459 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ly6dP35459 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ly6dP35459 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ly6dP35459 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ly6dP35459 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ly6dP35459 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ly6dP35459 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ly6dP35459 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ly6dP35459 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ly6dP35459 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ly6dP35459 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ly6dP35459 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ly6dP35459 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ly6dP35459 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ly6dP35459 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ly6dP35459 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ly6dP35459 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ly6dP35459 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ly6dP35459 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ly6dP35459 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ly6dP35459 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ly6dP35459 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ly6dP35459 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ly6dP35459 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ly6dP35459 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ly6dP35459 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ly6dP35459 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ly6dP35459 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms