Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxa2P31245 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Hoxa2P31245 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxa2P31245 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms