Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ctnnd1P30999 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ctnnd1P30999 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ctnnd1P30999 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ctnnd1P30999 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms