Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VtnP29788 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VtnP29788 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VtnP29788 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VtnP29788 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VtnP29788 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
VtnP29788 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VtnP29788 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VtnP29788 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VtnP29788 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VtnP29788 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VtnP29788 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VtnP29788 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VtnP29788 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VtnP29788 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VtnP29788 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VtnP29788 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VtnP29788 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VtnP29788 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VtnP29788 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VtnP29788 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VtnP29788 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VtnP29788 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VtnP29788 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VtnP29788 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VtnP29788 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VtnP29788 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VtnP29788 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VtnP29788 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VtnP29788 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VtnP29788 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VtnP29788 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VtnP29788 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VtnP29788 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VtnP29788 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VtnP29788 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VtnP29788 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VtnP29788 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VtnP29788 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VtnP29788 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VtnP29788 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
VtnP29788 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VtnP29788 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VtnP29788 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VtnP29788 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VtnP29788 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VtnP29788 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VtnP29788 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VtnP29788 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VtnP29788 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VtnP29788 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VtnP29788 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VtnP29788 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VtnP29788 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VtnP29788 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VtnP29788 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VtnP29788 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VtnP29788 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VtnP29788 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VtnP29788 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VtnP29788 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VtnP29788 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VtnP29788 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VtnP29788 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VtnP29788 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VtnP29788 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VtnP29788 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VtnP29788 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VtnP29788 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VtnP29788 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VtnP29788 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VtnP29788 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VtnP29788 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VtnP29788 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VtnP29788 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VtnP29788 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VtnP29788 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VtnP29788 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VtnP29788 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VtnP29788 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
VtnP29788 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VtnP29788 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VtnP29788 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VtnP29788 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VtnP29788 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VtnP29788 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VtnP29788 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VtnP29788 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VtnP29788 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VtnP29788 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VtnP29788 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VtnP29788 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VtnP29788 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VtnP29788 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VtnP29788 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VtnP29788 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VtnP29788 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VtnP29788 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VtnP29788 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VtnP29788 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 217.5 ms