Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PtprmP28828 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PtprmP28828 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PtprmP28828 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PtprmP28828 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PtprmP28828 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PtprmP28828 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PtprmP28828 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PtprmP28828 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PtprmP28828 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PtprmP28828 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PtprmP28828 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PtprmP28828 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PtprmP28828 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PtprmP28828 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PtprmP28828 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PtprmP28828 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PtprmP28828 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PtprmP28828 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PtprmP28828 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC30.82■■■□□ 2.53
PtprmP28828 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PtprmP28828 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PtprmP28828 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PtprmP28828 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PtprmP28828 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PtprmP28828 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PtprmP28828 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtprmP28828 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtprmP28828 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PtprmP28828 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PtprmP28828 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PtprmP28828 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PtprmP28828 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PtprmP28828 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PtprmP28828 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PtprmP28828 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PtprmP28828 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PtprmP28828 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PtprmP28828 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PtprmP28828 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PtprmP28828 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PtprmP28828 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PtprmP28828 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
PtprmP28828 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PtprmP28828 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PtprmP28828 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PtprmP28828 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PtprmP28828 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
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