Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kif3aP28741 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kif3aP28741 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Kif3aP28741 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 212 ms