Protein–RNA interactions for Protein: P28650

Adssl1, Adenylosuccinate synthetase isozyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adssl1P28650 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Adssl1P28650 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Adssl1P28650 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Adssl1P28650 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Adssl1P28650 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Adssl1P28650 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Adssl1P28650 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Adssl1P28650 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Adssl1P28650 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Adssl1P28650 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Adssl1P28650 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Adssl1P28650 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Adssl1P28650 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Adssl1P28650 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Adssl1P28650 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Adssl1P28650 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Adssl1P28650 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Adssl1P28650 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Adssl1P28650 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Adssl1P28650 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms