Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc6a9P28571 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Slc6a9P28571 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.9 ms