Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ctnna1P26231 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctnna1P26231 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ctnna1P26231 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.2 ms