Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Itgb7P26011 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Itgb7P26011 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Itgb7P26011 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Itgb7P26011 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 188.2 ms