Protein–RNA interactions for Protein: P24699

Myf5, Myogenic factor 5, mousemouse

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Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf5P24699 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myf5P24699 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myf5P24699 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myf5P24699 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myf5P24699 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myf5P24699 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myf5P24699 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myf5P24699 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myf5P24699 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Myf5P24699 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myf5P24699 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myf5P24699 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myf5P24699 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myf5P24699 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Myf5P24699 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myf5P24699 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myf5P24699 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myf5P24699 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Myf5P24699 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms