Protein–RNA interactions for Protein: P24399

Znf239, Zinc finger protein 239, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf239P24399 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Znf239P24399 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf239P24399 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf239P24399 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
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Znf239P24399 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf239P24399 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Znf239P24399 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf239P24399 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Znf239P24399 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Znf239P24399 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Znf239P24399 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf239P24399 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Znf239P24399 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Znf239P24399 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf239P24399 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf239P24399 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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