Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HdcP23738 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HdcP23738 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HdcP23738 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HdcP23738 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HdcP23738 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HdcP23738 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HdcP23738 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HdcP23738 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HdcP23738 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HdcP23738 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HdcP23738 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HdcP23738 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HdcP23738 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HdcP23738 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HdcP23738 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HdcP23738 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HdcP23738 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HdcP23738 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HdcP23738 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HdcP23738 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HdcP23738 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HdcP23738 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HdcP23738 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HdcP23738 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HdcP23738 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HdcP23738 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HdcP23738 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HdcP23738 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HdcP23738 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HdcP23738 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HdcP23738 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HdcP23738 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HdcP23738 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HdcP23738 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HdcP23738 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
HdcP23738 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
HdcP23738 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HdcP23738 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HdcP23738 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HdcP23738 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HdcP23738 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HdcP23738 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HdcP23738 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HdcP23738 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HdcP23738 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HdcP23738 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HdcP23738 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HdcP23738 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HdcP23738 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HdcP23738 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HdcP23738 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HdcP23738 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HdcP23738 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HdcP23738 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HdcP23738 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HdcP23738 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HdcP23738 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HdcP23738 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HdcP23738 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HdcP23738 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HdcP23738 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HdcP23738 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HdcP23738 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HdcP23738 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HdcP23738 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HdcP23738 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HdcP23738 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HdcP23738 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HdcP23738 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HdcP23738 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HdcP23738 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HdcP23738 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HdcP23738 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HdcP23738 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HdcP23738 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HdcP23738 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HdcP23738 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HdcP23738 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HdcP23738 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HdcP23738 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HdcP23738 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HdcP23738 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HdcP23738 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HdcP23738 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HdcP23738 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HdcP23738 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HdcP23738 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HdcP23738 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HdcP23738 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HdcP23738 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HdcP23738 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HdcP23738 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HdcP23738 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HdcP23738 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HdcP23738 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdcP23738 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdcP23738 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdcP23738 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HdcP23738 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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