Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PparaP23204 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PparaP23204 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PparaP23204 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PparaP23204 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PparaP23204 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PparaP23204 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PparaP23204 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PparaP23204 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PparaP23204 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PparaP23204 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PparaP23204 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PparaP23204 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PparaP23204 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PparaP23204 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PparaP23204 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PparaP23204 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PparaP23204 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PparaP23204 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PparaP23204 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PparaP23204 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PparaP23204 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PparaP23204 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PparaP23204 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PparaP23204 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PparaP23204 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PparaP23204 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PparaP23204 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PparaP23204 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PparaP23204 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PparaP23204 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PparaP23204 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PparaP23204 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PparaP23204 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PparaP23204 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PparaP23204 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PparaP23204 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PparaP23204 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PparaP23204 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PparaP23204 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PparaP23204 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PparaP23204 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PparaP23204 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PparaP23204 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PparaP23204 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PparaP23204 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PparaP23204 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PparaP23204 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PparaP23204 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PparaP23204 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PparaP23204 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PparaP23204 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PparaP23204 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PparaP23204 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PparaP23204 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PparaP23204 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PparaP23204 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PparaP23204 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PparaP23204 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PparaP23204 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PparaP23204 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PparaP23204 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PparaP23204 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PparaP23204 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PparaP23204 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PparaP23204 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PparaP23204 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PparaP23204 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PparaP23204 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PparaP23204 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PparaP23204 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PparaP23204 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PparaP23204 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PparaP23204 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PparaP23204 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PparaP23204 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PparaP23204 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PparaP23204 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PparaP23204 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PparaP23204 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PparaP23204 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PparaP23204 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PparaP23204 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PparaP23204 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PparaP23204 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PparaP23204 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PparaP23204 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PparaP23204 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PparaP23204 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PparaP23204 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PparaP23204 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PparaP23204 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PparaP23204 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PparaP23204 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PparaP23204 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PparaP23204 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PparaP23204 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PparaP23204 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PparaP23204 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PparaP23204 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.7 ms