Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ifrd1P19182 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ifrd1P19182 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ifrd1P19182 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms