Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pou4f1P17208 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pou4f1P17208 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pou4f1P17208 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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