Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sptan1P16546 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sptan1P16546 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sptan1P16546 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms