Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme1P15532 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme1P15532 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nme1P15532 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nme1P15532 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nme1P15532 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme1P15532 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme1P15532 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme1P15532 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme1P15532 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nme1P15532 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nme1P15532 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nme1P15532 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nme1P15532 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Nme1P15532 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nme1P15532 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nme1P15532 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nme1P15532 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme1P15532 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme1P15532 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme1P15532 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme1P15532 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme1P15532 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme1P15532 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme1P15532 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme1P15532 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme1P15532 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme1P15532 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.4 ms