Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RhoP15409 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RhoP15409 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RhoP15409 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RhoP15409 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RhoP15409 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RhoP15409 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RhoP15409 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RhoP15409 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RhoP15409 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RhoP15409 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RhoP15409 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RhoP15409 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RhoP15409 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RhoP15409 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RhoP15409 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RhoP15409 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RhoP15409 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RhoP15409 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RhoP15409 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RhoP15409 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RhoP15409 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RhoP15409 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RhoP15409 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RhoP15409 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RhoP15409 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RhoP15409 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RhoP15409 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RhoP15409 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RhoP15409 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RhoP15409 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RhoP15409 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RhoP15409 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RhoP15409 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RhoP15409 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RhoP15409 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RhoP15409 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RhoP15409 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RhoP15409 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RhoP15409 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RhoP15409 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RhoP15409 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RhoP15409 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RhoP15409 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RhoP15409 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RhoP15409 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RhoP15409 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RhoP15409 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RhoP15409 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RhoP15409 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RhoP15409 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RhoP15409 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RhoP15409 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RhoP15409 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RhoP15409 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RhoP15409 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RhoP15409 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RhoP15409 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RhoP15409 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RhoP15409 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RhoP15409 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RhoP15409 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RhoP15409 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RhoP15409 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RhoP15409 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RhoP15409 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RhoP15409 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RhoP15409 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RhoP15409 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RhoP15409 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RhoP15409 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RhoP15409 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RhoP15409 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RhoP15409 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RhoP15409 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RhoP15409 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RhoP15409 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RhoP15409 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RhoP15409 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RhoP15409 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RhoP15409 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RhoP15409 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RhoP15409 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RhoP15409 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RhoP15409 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RhoP15409 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RhoP15409 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RhoP15409 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RhoP15409 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RhoP15409 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RhoP15409 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RhoP15409 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RhoP15409 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RhoP15409 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RhoP15409 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RhoP15409 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RhoP15409 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RhoP15409 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RhoP15409 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RhoP15409 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms