Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timp1P12032 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp1P12032 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Timp1P12032 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timp1P12032 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timp1P12032 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Timp1P12032 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Timp1P12032 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Timp1P12032 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Timp1P12032 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Timp1P12032 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Timp1P12032 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Timp1P12032 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Timp1P12032 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Timp1P12032 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Timp1P12032 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Timp1P12032 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Timp1P12032 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Timp1P12032 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Timp1P12032 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Timp1P12032 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Timp1P12032 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Timp1P12032 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Timp1P12032 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Timp1P12032 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Timp1P12032 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Timp1P12032 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Timp1P12032 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Timp1P12032 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Timp1P12032 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Timp1P12032 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms