Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Schip1P0DPB4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Schip1P0DPB4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Schip1P0DPB4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms