Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxb8P09632 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxb8P09632 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxb8P09632 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms