Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Lamc1P02468 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Lamc1P02468 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lamc1P02468 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Lamc1P02468 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms