Protein–RNA interactions for Protein: P01811

Ig heavy chain V region UPC10, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01811 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01811 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01811 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01811 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01811 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01811 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01811 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01811 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01811 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01811 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01811 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01811 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01811 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01811 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01811 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01811 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01811 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01811 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01811 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01811 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01811 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01811 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01811 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01811 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01811 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01811 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01811 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01811 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01811 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01811 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01811 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01811 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01811 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01811 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01811 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01811 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01811 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01811 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01811 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01811 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01811 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01811 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01811 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01811 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01811 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01811 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01811 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01811 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01811 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01811 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01811 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01811 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01811 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01811 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01811 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01811 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01811 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01811 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01811 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01811 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01811 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01811 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01811 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01811 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01811 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01811 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01811 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01811 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01811 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01811 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01811 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01811 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01811 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01811 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01811 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01811 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01811 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01811 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01811 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01811 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01811 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01811 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01811 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01811 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01811 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01811 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01811 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01811 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01811 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01811 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01811 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01811 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01811 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01811 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01811 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01811 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01811 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01811 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01811 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01811 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms