Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01736 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01736 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01736 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01736 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01736 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01736 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01736 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01736 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01736 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01736 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01736 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01736 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01736 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01736 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01736 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01736 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01736 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01736 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01736 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01736 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01736 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01736 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01736 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01736 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01736 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01736 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01736 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01736 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01736 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01736 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01736 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01736 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01736 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01736 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01736 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01736 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01736 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01736 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01736 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01736 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01736 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01736 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01736 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01736 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01736 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01736 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01736 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01736 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01736 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01736 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01736 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01736 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01736 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01736 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01736 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01736 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01736 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01736 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01736 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01736 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01736 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01736 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01736 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01736 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01736 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01736 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01736 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01736 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01736 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01736 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01736 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01736 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01736 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01736 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01736 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01736 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01736 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01736 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01736 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01736 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01736 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01736 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01736 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01736 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01736 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01736 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01736 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01736 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01736 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01736 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01736 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01736 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01736 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01736 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01736 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01736 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01736 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01736 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01736 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms