Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01678 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01678 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01678 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01678 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01678 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01678 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01678 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01678 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01678 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
P01678 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01678 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01678 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01678 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01678 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01678 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01678 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01678 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01678 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01678 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01678 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01678 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01678 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01678 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01678 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01678 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01678 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01678 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01678 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01678 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01678 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01678 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01678 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
P01678 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
P01678 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01678 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01678 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01678 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01678 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01678 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01678 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01678 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01678 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
P01678 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01678 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01678 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01678 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01678 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01678 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01678 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01678 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01678 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
P01678 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01678 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01678 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
P01678 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01678 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01678 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01678 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01678 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
P01678 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01678 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01678 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01678 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01678 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01678 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01678 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01678 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01678 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01678 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01678 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01678 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01678 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01678 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01678 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01678 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01678 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01678 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01678 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01678 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01678 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01678 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
P01678 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
P01678 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01678 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01678 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01678 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01678 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01678 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01678 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01678 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01678 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01678 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01678 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01678 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01678 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01678 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01678 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01678 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
P01678 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms