Protein–RNA interactions for Protein: P01101

Fos, Proto-oncogene c-Fos, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosP01101 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FosP01101 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FosP01101 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FosP01101 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FosP01101 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FosP01101 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FosP01101 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FosP01101 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FosP01101 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FosP01101 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FosP01101 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FosP01101 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FosP01101 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FosP01101 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FosP01101 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FosP01101 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FosP01101 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FosP01101 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FosP01101 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FosP01101 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FosP01101 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FosP01101 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FosP01101 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FosP01101 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FosP01101 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FosP01101 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FosP01101 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FosP01101 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FosP01101 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FosP01101 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FosP01101 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FosP01101 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FosP01101 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FosP01101 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FosP01101 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FosP01101 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FosP01101 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FosP01101 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FosP01101 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FosP01101 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FosP01101 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FosP01101 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FosP01101 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FosP01101 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FosP01101 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FosP01101 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FosP01101 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FosP01101 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FosP01101 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FosP01101 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FosP01101 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FosP01101 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FosP01101 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FosP01101 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FosP01101 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FosP01101 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FosP01101 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FosP01101 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FosP01101 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FosP01101 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FosP01101 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FosP01101 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FosP01101 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FosP01101 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FosP01101 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FosP01101 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FosP01101 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FosP01101 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FosP01101 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FosP01101 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FosP01101 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FosP01101 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FosP01101 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FosP01101 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FosP01101 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FosP01101 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FosP01101 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FosP01101 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FosP01101 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FosP01101 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FosP01101 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FosP01101 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FosP01101 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FosP01101 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FosP01101 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FosP01101 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FosP01101 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FosP01101 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FosP01101 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FosP01101 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FosP01101 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FosP01101 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FosP01101 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FosP01101 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FosP01101 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FosP01101 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FosP01101 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FosP01101 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FosP01101 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FosP01101 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms