Protein–RNA interactions for Protein: O88974

Setdb1, Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setdb1O88974 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Setdb1O88974 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Setdb1O88974 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Setdb1O88974 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Setdb1O88974 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Setdb1O88974 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Setdb1O88974 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Setdb1O88974 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Setdb1O88974 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Setdb1O88974 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Setdb1O88974 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Setdb1O88974 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Setdb1O88974 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms