Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ShdO88834 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ShdO88834 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ShdO88834 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ShdO88834 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ShdO88834 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ShdO88834 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ShdO88834 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ShdO88834 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ShdO88834 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ShdO88834 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ShdO88834 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ShdO88834 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ShdO88834 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ShdO88834 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ShdO88834 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ShdO88834 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ShdO88834 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ShdO88834 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ShdO88834 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ShdO88834 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ShdO88834 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ShdO88834 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ShdO88834 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ShdO88834 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ShdO88834 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ShdO88834 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ShdO88834 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ShdO88834 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ShdO88834 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ShdO88834 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ShdO88834 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ShdO88834 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ShdO88834 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ShdO88834 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ShdO88834 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ShdO88834 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ShdO88834 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ShdO88834 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ShdO88834 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ShdO88834 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ShdO88834 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ShdO88834 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ShdO88834 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ShdO88834 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ShdO88834 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ShdO88834 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ShdO88834 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ShdO88834 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ShdO88834 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ShdO88834 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ShdO88834 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ShdO88834 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ShdO88834 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ShdO88834 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ShdO88834 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ShdO88834 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ShdO88834 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ShdO88834 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ShdO88834 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ShdO88834 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ShdO88834 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ShdO88834 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ShdO88834 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ShdO88834 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ShdO88834 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ShdO88834 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ShdO88834 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ShdO88834 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ShdO88834 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ShdO88834 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ShdO88834 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ShdO88834 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ShdO88834 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ShdO88834 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ShdO88834 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ShdO88834 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ShdO88834 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ShdO88834 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ShdO88834 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ShdO88834 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ShdO88834 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ShdO88834 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ShdO88834 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ShdO88834 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ShdO88834 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ShdO88834 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ShdO88834 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ShdO88834 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ShdO88834 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ShdO88834 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ShdO88834 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ShdO88834 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ShdO88834 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ShdO88834 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ShdO88834 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ShdO88834 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ShdO88834 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ShdO88834 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ShdO88834 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms