Protein–RNA interactions for Protein: O88708

Orc4, Origin recognition complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Orc4O88708 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Orc4O88708 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Orc4O88708 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Orc4O88708 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Orc4O88708 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Orc4O88708 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Orc4O88708 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Orc4O88708 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Orc4O88708 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Orc4O88708 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Orc4O88708 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Orc4O88708 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 211 ms