Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cops3O88543 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cops3O88543 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cops3O88543 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cops3O88543 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cops3O88543 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cops3O88543 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cops3O88543 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cops3O88543 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cops3O88543 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cops3O88543 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cops3O88543 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cops3O88543 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms