Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Dll3O88516 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dll3O88516 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dll3O88516 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dll3O88516 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Dll3O88516 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dll3O88516 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dll3O88516 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dll3O88516 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Dll3O88516 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dll3O88516 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dll3O88516 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Dll3O88516 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms