Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lnx1O70263 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lnx1O70263 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lnx1O70263 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms