Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Dsg2O55111 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Dsg2O55111 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Dsg2O55111 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms