Protein–RNA interactions for Protein: O55106

Strn, Striatin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StrnO55106 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
StrnO55106 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
StrnO55106 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
StrnO55106 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
StrnO55106 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
StrnO55106 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
StrnO55106 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
StrnO55106 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
StrnO55106 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
StrnO55106 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
StrnO55106 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
StrnO55106 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
StrnO55106 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
StrnO55106 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
StrnO55106 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
StrnO55106 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
StrnO55106 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
StrnO55106 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
StrnO55106 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
StrnO55106 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
StrnO55106 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
StrnO55106 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
StrnO55106 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
StrnO55106 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
StrnO55106 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
StrnO55106 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
StrnO55106 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
StrnO55106 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
StrnO55106 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
StrnO55106 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
StrnO55106 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
StrnO55106 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
StrnO55106 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
StrnO55106 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
StrnO55106 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
StrnO55106 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
StrnO55106 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
StrnO55106 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
StrnO55106 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
StrnO55106 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
StrnO55106 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
StrnO55106 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
StrnO55106 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
StrnO55106 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
StrnO55106 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
StrnO55106 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
StrnO55106 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
StrnO55106 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
StrnO55106 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
StrnO55106 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
StrnO55106 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
StrnO55106 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
StrnO55106 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
StrnO55106 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
StrnO55106 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
StrnO55106 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
StrnO55106 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
StrnO55106 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
StrnO55106 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
StrnO55106 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
StrnO55106 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
StrnO55106 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
StrnO55106 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
StrnO55106 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
StrnO55106 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
StrnO55106 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
StrnO55106 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
StrnO55106 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
StrnO55106 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
StrnO55106 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
StrnO55106 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
StrnO55106 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
StrnO55106 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
StrnO55106 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
StrnO55106 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
StrnO55106 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
StrnO55106 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
StrnO55106 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
StrnO55106 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
StrnO55106 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
StrnO55106 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
StrnO55106 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
StrnO55106 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
StrnO55106 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
StrnO55106 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
StrnO55106 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
StrnO55106 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
StrnO55106 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
StrnO55106 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
StrnO55106 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
StrnO55106 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
StrnO55106 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
StrnO55106 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
StrnO55106 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
StrnO55106 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
StrnO55106 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
StrnO55106 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
StrnO55106 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
StrnO55106 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
StrnO55106 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms