Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SlkO54988 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SlkO54988 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SlkO54988 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SlkO54988 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SlkO54988 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SlkO54988 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SlkO54988 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SlkO54988 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SlkO54988 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SlkO54988 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SlkO54988 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SlkO54988 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SlkO54988 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SlkO54988 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SlkO54988 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SlkO54988 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SlkO54988 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SlkO54988 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SlkO54988 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SlkO54988 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SlkO54988 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SlkO54988 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SlkO54988 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SlkO54988 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SlkO54988 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SlkO54988 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SlkO54988 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SlkO54988 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SlkO54988 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SlkO54988 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SlkO54988 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SlkO54988 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SlkO54988 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SlkO54988 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SlkO54988 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SlkO54988 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SlkO54988 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SlkO54988 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SlkO54988 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SlkO54988 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SlkO54988 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SlkO54988 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SlkO54988 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SlkO54988 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SlkO54988 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SlkO54988 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SlkO54988 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SlkO54988 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SlkO54988 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SlkO54988 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SlkO54988 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SlkO54988 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SlkO54988 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SlkO54988 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SlkO54988 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SlkO54988 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SlkO54988 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SlkO54988 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SlkO54988 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SlkO54988 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SlkO54988 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SlkO54988 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SlkO54988 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SlkO54988 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SlkO54988 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SlkO54988 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SlkO54988 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SlkO54988 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SlkO54988 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SlkO54988 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SlkO54988 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SlkO54988 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SlkO54988 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SlkO54988 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SlkO54988 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SlkO54988 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SlkO54988 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SlkO54988 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SlkO54988 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SlkO54988 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SlkO54988 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SlkO54988 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SlkO54988 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SlkO54988 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SlkO54988 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SlkO54988 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SlkO54988 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SlkO54988 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SlkO54988 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SlkO54988 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SlkO54988 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SlkO54988 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SlkO54988 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SlkO54988 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SlkO54988 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SlkO54988 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SlkO54988 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SlkO54988 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SlkO54988 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms