Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tpd52l1O54818 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Tpd52l1O54818 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tpd52l1O54818 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms