Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
IfnabL7MTU6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IfnabL7MTU6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IfnabL7MTU6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms