Protein–RNA interactions for Protein: L7MTS5

Gm12794, Predicted gene 12794, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12794L7MTS5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm12794L7MTS5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm12794L7MTS5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm12794L7MTS5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm12794L7MTS5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm12794L7MTS5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm12794L7MTS5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm12794L7MTS5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm12794L7MTS5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm12794L7MTS5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm12794L7MTS5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm12794L7MTS5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm12794L7MTS5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm12794L7MTS5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm12794L7MTS5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm12794L7MTS5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm12794L7MTS5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm12794L7MTS5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm12794L7MTS5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm12794L7MTS5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm12794L7MTS5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm12794L7MTS5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm12794L7MTS5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm12794L7MTS5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm12794L7MTS5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm12794L7MTS5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms