Protein–RNA interactions for Protein: K9J7F4

Gm8720, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8720K9J7F4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8720K9J7F4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8720K9J7F4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8720K9J7F4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8720K9J7F4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8720K9J7F4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8720K9J7F4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8720K9J7F4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8720K9J7F4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm8720K9J7F4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm8720K9J7F4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm8720K9J7F4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms