Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ59

Gm3383, Predicted gene 3194, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3383J3QQ59 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm3383J3QQ59 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm3383J3QQ59 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm3383J3QQ59 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms