Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gm2056J3QQ02 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm2056J3QQ02 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Gm2056J3QQ02 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms