Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm20825J3QM67 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20825J3QM67 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms