Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930544D05RikJ3QK56 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930544D05RikJ3QK56 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930544D05RikJ3QK56 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms