Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem200cJ3QK46 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmem200cJ3QK46 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Tmem200cJ3QK46 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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