Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Arfgef1G3X9K3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Arfgef1G3X9K3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arfgef1G3X9K3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms